Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN1Q05586 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIN1Q05586 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRIN1Q05586 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms