Protein–RNA interactions for Protein: Q04602

VBA4, Vacuolar basic amino acid transporter 4, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA4Q04602 SEC28YIL076W 891 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 ZRT2YLR130C 1269 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 PRM9YAR031W 897 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 SEC13YLR208W 894 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 TSA1YML028W 591 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YOL107WYOL107W 1029 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 MRPS16YPL013C 366 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 CAR1YPL111W 1002 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 TAZ1YPR140W 1146 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 DFG5YMR238W 1377 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YTP1YNL237W 1380 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 MNN5YJL186W 1761 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 TED1YIL039W 1422 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 WHI2YOR043W 1461 nt5.39□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 KEX2YNL238W 2445 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 PRP9YDL030W 1593 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 GAS2YLR343W 1668 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 RRG1YDR065W 1098 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 HSP150YJL159W 1242 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 EBP2YKL172W 1284 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YKR047WYKR047W 306 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 SPC3YLR066W 555 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 CPR6YLR216C 1116 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YLR374CYLR374C 390 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YNL226WYNL226W 411 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 ATG29YPL166W 642 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 PDR18YNR070W 4002 nt5.38□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 PIB1YDR313C 861 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 RRP17YDR412W 708 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YDR445CYDR445C 408 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 HAT2YEL056W 1206 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 KSS1YGR040W 1107 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 CIA2YHR122W 696 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 BCY1YIL033C 1251 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 AIM23YJL131C 1071 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 RPS5YJR123W 678 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 DID4YKL002W 699 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YBL077WYBL077W 432 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YOL162WYOL162W 648 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 MTC1YJL123C 1437 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 PIF1YML061C 2580 nt5.37□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 PRD1YCL057W 2139 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YEL068CYEL068C 333 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 COS4YFL062W 1140 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 BUD32YGR262C 786 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 BGL2YGR282C 942 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YIL152WYIL152W 708 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 SFH5YJL145W 885 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 RIT1YMR283C 1542 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 SKS1YPL026C 1509 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 MDM31YHR194W 1740 nt5.36□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 PYC2YBR218C 3543 nt5.35□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 MCM6YGL201C 3054 nt5.35□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 GCR2YNL199C 1605 nt5.35□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 KCH1YJR054W 1494 nt5.35□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 HST3YOR025W 1344 nt5.35□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 RNY1YPL123C 1305 nt5.35□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 RHO4YKR055W 876 nt5.35□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 VMA4YOR332W 702 nt5.35□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 SCT1YBL011W 2280 nt5.35□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 AIM10YER087W 1731 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 CLB1YGR108W 1416 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 MEC3YLR288C 1425 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 UBP9YER098W 2265 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 TEP1YNL128W 1305 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 RSM10YDR041W 612 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 NUP42YDR192C 1293 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 RPE1YJL121C 717 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 TAL1YLR354C 1008 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 URA4YLR420W 1095 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 HAP3YBL021C 435 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 HEK2YBL032W 1146 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 MER1YNL210W 813 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 YPR114WYPR114W 948 nt5.34□□□□□ -1.55
VBA4Q04602 RAD53YPL153C 2466 nt5.34□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 ARN2YHL047C 1863 nt5.33□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 DOS2YDR068W 933 nt5.33□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 PHO92YDR374C 921 nt5.33□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 RML2YEL050C 1182 nt5.33□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 PAN5YHR063C 1140 nt5.33□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 LIP2YLR239C 987 nt5.33□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 SPS4YOR313C 1017 nt5.33□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 YPL191CYPL191C 1083 nt5.33□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 IFA38YBR159W 1044 nt5.33□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 PRP19YLL036C 1512 nt5.33□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 SDA1YGR245C 2304 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 IBA57YJR122W 1494 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 PHO12YHR215W 1404 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 PHO11YAR071W 1404 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 YTA12YMR089C 2478 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 UTP7YER082C 1665 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 RPT3YDR394W 1287 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 PAU17YLL025W 375 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 MPD1YOR288C 957 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 ENV7YPL236C 1095 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 GLN1YPR035W 1113 nt5.32□□□□□ -1.56
VBA4Q04602 snR3snR3 194 nt5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms