Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF90Q03938 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF90Q03938 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF90Q03938 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms