Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 RHB1YCR027C 630 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 RIM101YHL027W 1878 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 YLL017WYLL017W 312 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 YLR036CYLR036C 612 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 RPS0BYLR048W 759 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 GFD1YMR255W 567 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 YOL131WYOL131W 327 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 RBD2YPL246C 789 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 MCX1YBR227C 1563 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 EKI1YDR147W 1605 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 MID1YNL291C 1647 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 FKH1YIL131C 1455 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 APL6YGR261C 2430 nt5.95□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 MST1YKL194C 1389 nt5.94□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 ADE13YLR359W 1449 nt5.94□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 ISA2YPR067W 558 nt5.94□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 TRM8YDL201W 861 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 LDB17YDL146W 1476 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 TRK2YKR050W 2670 nt5.93□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 SYN8YAL014C 768 nt5.92□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 PSR1YLL010C 1284 nt5.92□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 TFS1YLR178C 660 nt5.92□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 VTA1YLR181C 993 nt5.92□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 TIF34YMR146C 1044 nt5.92□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 DAL82YNL314W 768 nt5.92□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 PIN2YOR104W 849 nt5.92□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 ACF2YLR144C 2340 nt5.92□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 KEX2YNL238W 2445 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 YDL109CYDL109C 1944 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 KEL1YHR158C 3495 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 SHE10YGL228W 1734 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 ADY2YCR010C 852 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 COX26YDR119W-A 201 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 YLR194CYLR194C 765 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 PGA3YML125C 939 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 YNL019CYNL019C 855 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 YNL033WYNL033W 855 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 RRT2YBR246W 1164 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 SRB6YBR253W 366 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 SAP155YFR040W 3009 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 RRN3YKL125W 1884 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 THI22YPR121W 1719 nt5.91□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 SAS10YDL153C 1833 nt5.9□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 MBP1YDL056W 2502 nt5.9□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 IDP1YDL066W 1287 nt5.9□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 RTN1YDR233C 888 nt5.9□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 PSH1YOL054W 1221 nt5.9□□□□□ -1.46
CEF1Q03654 PRM7YDL039C 2097 nt5.9□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 DEG1YFL001W 1329 nt5.9□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 RAD57YDR004W 1383 nt5.9□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 WTM2YOR229W 1404 nt5.9□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 CLB2YPR119W 1476 nt5.9□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 UBA2YDR390C 1911 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 KRS1YDR037W 1776 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 CWC21YDR482C 408 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 GRX4YER174C 735 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 PRM9YAR031W 897 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 HCR1YLR192C 798 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 NMD4YLR363C 657 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 CAM1YPL048W 1248 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 MPH2YDL247W 1830 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 RTT106YNL206C 1368 nt5.89□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 MKS1YNL076W 1755 nt5.88□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 SFB3YHR098C 2790 nt5.88□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 MED2YDL005C 1296 nt5.88□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YLR402WYLR402W 192 nt5.88□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 PAF1YBR279W 1338 nt5.88□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 SEO1YAL067C 1782 nt5.88□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 GYP1YOR070C 1914 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 SEC9YGR009C 1956 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 PMT5YDL093W 2232 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 PTK2YJR059W 2457 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 PCL9YDL179W 915 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 MRPL7YDR237W 879 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 HPM1YIL110W 1134 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YJR085CYJR085C 318 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 POR1YNL055C 852 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YGP1YNL160W 1065 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 ECM33YBR078W 1290 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 ARG4YHR018C 1392 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 UTP7YER082C 1665 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 ARN1YHL040C 1884 nt5.87□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 AMA1YGR225W 1782 nt5.86□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 YBR139WYBR139W 1527 nt5.86□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.86□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 MHO1YJR008W 1017 nt5.86□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 COS9YKL219W 1224 nt5.86□□□□□ -1.47
CEF1Q03654 ARG1YOL058W 1263 nt5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.5 ms