Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFHR1Q03591 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFHR1Q03591 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFHR1Q03591 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms