Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC25A11Q02978 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC25A11Q02978 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC25A11Q02978 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms