Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
TOP2BQ02880 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC39■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
TOP2BQ02880 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC38.9■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
TOP2BQ02880 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC38.85■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
TOP2BQ02880 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398.3 ms