Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DSC2Q02487 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSC2Q02487 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSC2Q02487 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms