Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTBN1Q01082 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTBN1Q01082 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTBN1Q01082 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms