Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PRCDQ00LT1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRCDQ00LT1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRCDQ00LT1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms