Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NFKB2Q00653 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKB2Q00653 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms