Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PITPNAQ00169 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PITPNAQ00169 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PITPNAQ00169 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms