Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG7P83436 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG7P83436 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG7P83436 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG7P83436 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COG7P83436 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG7P83436 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG7P83436 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG7P83436 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG7P83436 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG7P83436 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG7P83436 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COG7P83436 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG7P83436 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COG7P83436 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG7P83436 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG7P83436 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG7P83436 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG7P83436 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG7P83436 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG7P83436 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG7P83436 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COG7P83436 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG7P83436 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG7P83436 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG7P83436 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG7P83436 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COG7P83436 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG7P83436 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COG7P83436 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG7P83436 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG7P83436 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG7P83436 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG7P83436 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG7P83436 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG7P83436 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG7P83436 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COG7P83436 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG7P83436 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG7P83436 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG7P83436 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG7P83436 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG7P83436 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG7P83436 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG7P83436 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG7P83436 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COG7P83436 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG7P83436 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG7P83436 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COG7P83436 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG7P83436 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG7P83436 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COG7P83436 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COG7P83436 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG7P83436 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG7P83436 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG7P83436 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG7P83436 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG7P83436 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG7P83436 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG7P83436 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG7P83436 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COG7P83436 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COG7P83436 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG7P83436 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG7P83436 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG7P83436 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG7P83436 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG7P83436 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COG7P83436 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG7P83436 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG7P83436 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG7P83436 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG7P83436 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG7P83436 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG7P83436 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COG7P83436 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COG7P83436 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COG7P83436 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COG7P83436 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COG7P83436 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms