Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TMF1P82094 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TMF1P82094 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMF1P82094 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMF1P82094 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMF1P82094 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMF1P82094 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMF1P82094 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMF1P82094 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TMF1P82094 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
TMF1P82094 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TMF1P82094 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TMF1P82094 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TMF1P82094 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TMF1P82094 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
TMF1P82094 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TMF1P82094 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TMF1P82094 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TMF1P82094 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TMF1P82094 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TMF1P82094 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TMF1P82094 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMF1P82094 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMF1P82094 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMF1P82094 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMF1P82094 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMF1P82094 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMF1P82094 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TMF1P82094 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TMF1P82094 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TMF1P82094 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TMF1P82094 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMF1P82094 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMF1P82094 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMF1P82094 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMF1P82094 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMF1P82094 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMF1P82094 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMF1P82094 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TMF1P82094 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TMF1P82094 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TMF1P82094 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TMF1P82094 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TMF1P82094 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TMF1P82094 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TMF1P82094 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
TMF1P82094 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TMF1P82094 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TMF1P82094 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TMF1P82094 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TMF1P82094 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TMF1P82094 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32■■■□□ 2.71
TMF1P82094 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMF1P82094 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMF1P82094 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMF1P82094 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMF1P82094 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMF1P82094 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMF1P82094 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMF1P82094 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMF1P82094 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TMF1P82094 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TMF1P82094 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TMF1P82094 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TMF1P82094 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TMF1P82094 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TMF1P82094 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TMF1P82094 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TMF1P82094 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TMF1P82094 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TMF1P82094 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TMF1P82094 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TMF1P82094 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TMF1P82094 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TMF1P82094 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TMF1P82094 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TMF1P82094 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TMF1P82094 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TMF1P82094 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TMF1P82094 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TMF1P82094 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TMF1P82094 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TMF1P82094 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TMF1P82094 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TMF1P82094 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TMF1P82094 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TMF1P82094 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TMF1P82094 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms