Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITX1P78337 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PITX1P78337 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PITX1P78337 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITX1P78337 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITX1P78337 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITX1P78337 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITX1P78337 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITX1P78337 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PITX1P78337 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITX1P78337 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITX1P78337 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITX1P78337 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITX1P78337 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITX1P78337 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX1P78337 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX1P78337 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX1P78337 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX1P78337 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX1P78337 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITX1P78337 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PITX1P78337 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITX1P78337 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITX1P78337 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITX1P78337 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITX1P78337 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITX1P78337 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITX1P78337 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITX1P78337 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITX1P78337 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITX1P78337 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITX1P78337 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITX1P78337 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITX1P78337 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITX1P78337 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITX1P78337 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITX1P78337 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITX1P78337 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITX1P78337 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITX1P78337 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms