Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM193AP78312 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM193AP78312 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM193AP78312 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms