Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RAB1AP62820 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB1AP62820 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB1AP62820 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms