Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSNL1P62760 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VSNL1P62760 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VSNL1P62760 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms