Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPD3P62318 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNRPD3P62318 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNRPD3P62318 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms