Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RPS29P62273 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RPS29P62273 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPS29P62273 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPS29P62273 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RPS29P62273 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RPS29P62273 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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