Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMO4P61968 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO4P61968 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO4P61968 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO4P61968 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO4P61968 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO4P61968 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO4P61968 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMO4P61968 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO4P61968 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO4P61968 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO4P61968 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO4P61968 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LMO4P61968 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO4P61968 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO4P61968 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO4P61968 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO4P61968 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO4P61968 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO4P61968 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO4P61968 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO4P61968 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LMO4P61968 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO4P61968 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO4P61968 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO4P61968 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO4P61968 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO4P61968 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO4P61968 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO4P61968 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO4P61968 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LMO4P61968 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMO4P61968 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMO4P61968 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMO4P61968 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LMO4P61968 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMO4P61968 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMO4P61968 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMO4P61968 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO4P61968 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO4P61968 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO4P61968 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO4P61968 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO4P61968 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO4P61968 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMO4P61968 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO4P61968 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO4P61968 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO4P61968 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO4P61968 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO4P61968 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO4P61968 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms