Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCALDP61601 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCALDP61601 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCALDP61601 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCALDP61601 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCALDP61601 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCALDP61601 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCALDP61601 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCALDP61601 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCALDP61601 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCALDP61601 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCALDP61601 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCALDP61601 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCALDP61601 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCALDP61601 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCALDP61601 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCALDP61601 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCALDP61601 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCALDP61601 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCALDP61601 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCALDP61601 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCALDP61601 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCALDP61601 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCALDP61601 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCALDP61601 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCALDP61601 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCALDP61601 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCALDP61601 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCALDP61601 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCALDP61601 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCALDP61601 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCALDP61601 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCALDP61601 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCALDP61601 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCALDP61601 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCALDP61601 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCALDP61601 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCALDP61601 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCALDP61601 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCALDP61601 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCALDP61601 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCALDP61601 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCALDP61601 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCALDP61601 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCALDP61601 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCALDP61601 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCALDP61601 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCALDP61601 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCALDP61601 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCALDP61601 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCALDP61601 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCALDP61601 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCALDP61601 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCALDP61601 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCALDP61601 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCALDP61601 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCALDP61601 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCALDP61601 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCALDP61601 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCALDP61601 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCALDP61601 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCALDP61601 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCALDP61601 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCALDP61601 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCALDP61601 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCALDP61601 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCALDP61601 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCALDP61601 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCALDP61601 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCALDP61601 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCALDP61601 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCALDP61601 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCALDP61601 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCALDP61601 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCALDP61601 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCALDP61601 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCALDP61601 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCALDP61601 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCALDP61601 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCALDP61601 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCALDP61601 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCALDP61601 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NCALDP61601 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCALDP61601 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCALDP61601 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCALDP61601 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCALDP61601 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms