Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RHBDL3P58872 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RHBDL3P58872 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHBDL3P58872 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
RHBDL3P58872 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDL3P58872 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDL3P58872 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDL3P58872 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDL3P58872 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHBDL3P58872 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms