Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SH3BGRP55822 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SH3BGRP55822 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SH3BGRP55822 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms