Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OXCT1P55809 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OXCT1P55809 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OXCT1P55809 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms