Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFERP55789 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFERP55789 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFERP55789 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GFERP55789 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFERP55789 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFERP55789 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFERP55789 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GFERP55789 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GFERP55789 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GFERP55789 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFERP55789 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFERP55789 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GFERP55789 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GFERP55789 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFERP55789 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFERP55789 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFERP55789 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GFERP55789 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFERP55789 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFERP55789 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFERP55789 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFERP55789 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFERP55789 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFERP55789 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFERP55789 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GFERP55789 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFERP55789 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFERP55789 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFERP55789 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GFERP55789 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFERP55789 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFERP55789 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFERP55789 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFERP55789 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFERP55789 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFERP55789 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFERP55789 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GFERP55789 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GFERP55789 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFERP55789 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFERP55789 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFERP55789 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFERP55789 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFERP55789 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GFERP55789 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GFERP55789 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFERP55789 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GFERP55789 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms