Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH15P55291 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH15P55291 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH15P55291 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH15P55291 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH15P55291 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH15P55291 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH15P55291 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH15P55291 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH15P55291 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH15P55291 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH15P55291 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH15P55291 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH15P55291 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH15P55291 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH15P55291 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH15P55291 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH15P55291 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH15P55291 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH15P55291 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH15P55291 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH15P55291 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH15P55291 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH15P55291 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH15P55291 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH15P55291 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH15P55291 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH15P55291 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH15P55291 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH15P55291 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH15P55291 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH15P55291 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH15P55291 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH15P55291 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH15P55291 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms