Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 YOL024WYOL024W 519 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 PIN2YOR104W 849 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 CLD1YGR110W 1338 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL058CP53947 MST1YKL194C 1389 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YDL241WYDL241W 372 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 MRPL25YGR076C 474 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 GTO1YGR154C 1071 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 Q0144Q0144 330 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YLL017WYLL017W 312 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 RRT7YLL030C 342 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 SEN34YAR008W 828 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YLR311CYLR311C 348 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 UBP7YIL156W 3216 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 PDC1YLR044C 1692 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 STP4YDL048C 1473 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 ATR1YML116W 1629 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 FAA3YIL009W 2085 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 RTN1YDR233C 888 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 NOP13YNL175C 1212 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YPL102CYPL102C 303 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 TFG1YGR186W 2208 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 HXT3YDR345C 1704 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 SHE10YGL228W 1734 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 OCA5YHL029C 2040 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 VID30YGL227W 2877 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 GIP2YER054C 1647 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 HIR2YOR038C 2628 nt5.44□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 LPL1YOR059C 1353 nt5.44□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YDR541CYDR541C 1035 nt5.44□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 RPT1YKL145W 1404 nt5.44□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 SNN1YNL086W 309 nt5.44□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YGP1YNL160W 1065 nt5.44□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YPL014WYPL014W 1146 nt5.44□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 UIP4YPL186C 915 nt5.44□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 HRP1YOL123W 1605 nt5.44□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 BRF1YGR246C 1791 nt5.43□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YDR154CYDR154C 351 nt5.43□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.43□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.43□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 SCP1YOR367W 603 nt5.43□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 UBC4YBR082C 447 nt5.43□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.43□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 CLB5YPR120C 1308 nt5.43□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 ALG2YGL065C 1512 nt5.43□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 PRP43YGL120C 2304 nt5.42□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YDL034WYDL034W 345 nt5.42□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 MCM21YDR318W 1107 nt5.42□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 PSR1YLL010C 1284 nt5.42□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 GEP3YOR205C 1671 nt5.42□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 HUL4YJR036C 2679 nt5.42□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 TSL1YML100W 3297 nt5.42□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 RPT2YDL007W 1314 nt5.42□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 ABF1YKL112W 2196 nt5.42□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 PMT5YDL093W 2232 nt5.42□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 DPH2YKL191W 1605 nt5.41□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 SIA1YOR137C 1869 nt5.41□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 DED81YHR019C 1665 nt5.41□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 MAF1YDR005C 1188 nt5.41□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt5.41□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 RMI1YPL024W 726 nt5.41□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 YBR139WYBR139W 1527 nt5.41□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 RAT1YOR048C 3021 nt5.41□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 ESF1YDR365C 1887 nt5.41□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 FRE3YOR381W 2136 nt5.41□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 LCB2YDR062W 1686 nt5.4□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 CBP1YJL209W 1965 nt5.4□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 CPS1YJL172W 1731 nt5.4□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 COX26YDR119W-A 201 nt5.4□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 UPS3YDR185C 540 nt5.4□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 CNL1YDR357C 369 nt5.4□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 PEX22YAL055W 543 nt5.4□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 PPA2YMR267W 933 nt5.4□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 GPM3YOL056W 912 nt5.4□□□□□ -1.54
YNL058CP53947 CTF18YMR078C 2226 nt5.4□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YGL036WYGL036W 2730 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 TGL4YKR089C 2733 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 MET3YJR010W 1536 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 AAD6YFL056C 639 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 HPM1YIL110W 1134 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YLR036CYLR036C 612 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 MTF1YMR228W 1026 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 LEM3YNL323W 1245 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 RAD17YOR368W 1206 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YHR045WYHR045W 1683 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 ZUO1YGR285C 1302 nt5.39□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 DOA1YKL213C 2148 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 NRD1YNL251C 1728 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YDL144CYDL144C 1071 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YER084WYER084W 387 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YGR022CYGR022C 330 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YLF2YHL014C 1218 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YHR022CYHR022C 771 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 MND2YIR025W 1107 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 YJR056CYJR056C 711 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 SNO4YMR322C 714 nt5.38□□□□□ -1.55
YNL058CP53947 HSP33YOR391C 714 nt5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 96.7 ms