Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIMK2P53671 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK2P53671 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms