Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
EFNA4P52798 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EFNA4P52798 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms