Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RORCP51449 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RORCP51449 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RORCP51449 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RORCP51449 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RORCP51449 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RORCP51449 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RORCP51449 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RORCP51449 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RORCP51449 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RORCP51449 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RORCP51449 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RORCP51449 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RORCP51449 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RORCP51449 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RORCP51449 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RORCP51449 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RORCP51449 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RORCP51449 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RORCP51449 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RORCP51449 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RORCP51449 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RORCP51449 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RORCP51449 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RORCP51449 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RORCP51449 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RORCP51449 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RORCP51449 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RORCP51449 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RORCP51449 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RORCP51449 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
RORCP51449 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RORCP51449 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RORCP51449 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RORCP51449 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RORCP51449 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RORCP51449 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RORCP51449 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RORCP51449 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RORCP51449 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RORCP51449 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RORCP51449 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RORCP51449 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RORCP51449 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RORCP51449 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RORCP51449 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RORCP51449 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RORCP51449 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RORCP51449 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORCP51449 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORCP51449 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORCP51449 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORCP51449 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORCP51449 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORCP51449 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORCP51449 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORCP51449 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORCP51449 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RORCP51449 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms