Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE6CP51160 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDE6CP51160 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDE6CP51160 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms