Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK7P50613 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK7P50613 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK7P50613 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK7P50613 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK7P50613 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK7P50613 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK7P50613 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK7P50613 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK7P50613 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK7P50613 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK7P50613 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK7P50613 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK7P50613 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK7P50613 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK7P50613 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK7P50613 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK7P50613 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK7P50613 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK7P50613 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK7P50613 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK7P50613 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDK7P50613 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK7P50613 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK7P50613 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK7P50613 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK7P50613 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK7P50613 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK7P50613 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK7P50613 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK7P50613 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK7P50613 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDK7P50613 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK7P50613 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK7P50613 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK7P50613 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK7P50613 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK7P50613 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK7P50613 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK7P50613 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK7P50613 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK7P50613 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDK7P50613 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK7P50613 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK7P50613 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK7P50613 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDK7P50613 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK7P50613 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK7P50613 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK7P50613 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK7P50613 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK7P50613 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK7P50613 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK7P50613 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDK7P50613 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK7P50613 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK7P50613 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK7P50613 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK7P50613 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK7P50613 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK7P50613 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK7P50613 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDK7P50613 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK7P50613 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK7P50613 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK7P50613 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK7P50613 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK7P50613 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK7P50613 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK7P50613 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDK7P50613 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK7P50613 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK7P50613 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK7P50613 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK7P50613 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK7P50613 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK7P50613 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDK7P50613 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK7P50613 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK7P50613 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK7P50613 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDK7P50613 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDK7P50613 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK7P50613 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK7P50613 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK7P50613 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK7P50613 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDK7P50613 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDK7P50613 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms