Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX5P50542 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX5P50542 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX5P50542 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX5P50542 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PEX5P50542 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PEX5P50542 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX5P50542 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX5P50542 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX5P50542 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX5P50542 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX5P50542 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX5P50542 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX5P50542 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX5P50542 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX5P50542 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX5P50542 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX5P50542 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX5P50542 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX5P50542 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX5P50542 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX5P50542 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX5P50542 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX5P50542 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX5P50542 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX5P50542 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX5P50542 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX5P50542 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX5P50542 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX5P50542 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX5P50542 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX5P50542 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX5P50542 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX5P50542 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX5P50542 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX5P50542 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX5P50542 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX5P50542 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX5P50542 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PEX5P50542 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX5P50542 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX5P50542 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX5P50542 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX5P50542 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX5P50542 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX5P50542 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX5P50542 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX5P50542 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX5P50542 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX5P50542 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX5P50542 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX5P50542 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX5P50542 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX5P50542 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX5P50542 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX5P50542 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX5P50542 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX5P50542 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX5P50542 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX5P50542 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX5P50542 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX5P50542 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX5P50542 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX5P50542 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX5P50542 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX5P50542 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX5P50542 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX5P50542 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX5P50542 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms