Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC34P49427 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC34P49427 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC34P49427 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC34P49427 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC34P49427 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC34P49427 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC34P49427 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC34P49427 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC34P49427 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC34P49427 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC34P49427 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC34P49427 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC34P49427 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC34P49427 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC34P49427 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC34P49427 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC34P49427 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC34P49427 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC34P49427 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC34P49427 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC34P49427 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC34P49427 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC34P49427 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC34P49427 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC34P49427 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC34P49427 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC34P49427 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC34P49427 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC34P49427 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC34P49427 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC34P49427 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC34P49427 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC34P49427 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC34P49427 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC34P49427 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC34P49427 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC34P49427 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDC34P49427 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDC34P49427 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDC34P49427 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC34P49427 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC34P49427 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC34P49427 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC34P49427 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC34P49427 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC34P49427 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC34P49427 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms