Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX1P48742 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX1P48742 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LHX1P48742 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX1P48742 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX1P48742 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX1P48742 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX1P48742 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX1P48742 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX1P48742 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX1P48742 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX1P48742 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LHX1P48742 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX1P48742 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX1P48742 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX1P48742 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX1P48742 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LHX1P48742 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX1P48742 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX1P48742 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX1P48742 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX1P48742 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX1P48742 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX1P48742 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX1P48742 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX1P48742 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LHX1P48742 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX1P48742 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX1P48742 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX1P48742 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX1P48742 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX1P48742 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX1P48742 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX1P48742 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX1P48742 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX1P48742 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LHX1P48742 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX1P48742 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX1P48742 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX1P48742 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX1P48742 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LHX1P48742 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX1P48742 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX1P48742 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX1P48742 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LHX1P48742 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX1P48742 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX1P48742 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX1P48742 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX1P48742 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LHX1P48742 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX1P48742 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX1P48742 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX1P48742 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX1P48742 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX1P48742 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX1P48742 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX1P48742 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LHX1P48742 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX1P48742 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX1P48742 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX1P48742 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LHX1P48742 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX1P48742 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX1P48742 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX1P48742 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX1P48742 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX1P48742 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LHX1P48742 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX1P48742 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX1P48742 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX1P48742 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX1P48742 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX1P48742 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX1P48742 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX1P48742 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX1P48742 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LHX1P48742 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LHX1P48742 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX1P48742 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX1P48742 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LHX1P48742 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX1P48742 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX1P48742 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX1P48742 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LHX1P48742 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX1P48742 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX1P48742 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX1P48742 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LHX1P48742 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms