Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP5P45974 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP5P45974 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP5P45974 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP5P45974 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP5P45974 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP5P45974 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP5P45974 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP5P45974 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP5P45974 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP5P45974 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP5P45974 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP5P45974 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP5P45974 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP5P45974 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP5P45974 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP5P45974 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP5P45974 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP5P45974 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP5P45974 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP5P45974 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP5P45974 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP5P45974 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP5P45974 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP5P45974 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP5P45974 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP5P45974 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP5P45974 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP5P45974 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP5P45974 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP5P45974 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP5P45974 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP5P45974 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP5P45974 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP5P45974 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP5P45974 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP5P45974 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP5P45974 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP5P45974 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP5P45974 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP5P45974 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP5P45974 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP5P45974 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP5P45974 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP5P45974 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP5P45974 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP5P45974 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP5P45974 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP5P45974 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP5P45974 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP5P45974 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP5P45974 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP5P45974 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP5P45974 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP5P45974 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP5P45974 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP5P45974 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP5P45974 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP5P45974 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP5P45974 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP5P45974 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP5P45974 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP5P45974 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP5P45974 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP5P45974 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP5P45974 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP5P45974 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP5P45974 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms