Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCAMP43121 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCAMP43121 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCAMP43121 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCAMP43121 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCAMP43121 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCAMP43121 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCAMP43121 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCAMP43121 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MCAMP43121 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCAMP43121 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCAMP43121 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MCAMP43121 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCAMP43121 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCAMP43121 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCAMP43121 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCAMP43121 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCAMP43121 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MCAMP43121 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MCAMP43121 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCAMP43121 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCAMP43121 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCAMP43121 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCAMP43121 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MCAMP43121 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCAMP43121 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MCAMP43121 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MCAMP43121 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MCAMP43121 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MCAMP43121 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MCAMP43121 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCAMP43121 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCAMP43121 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCAMP43121 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCAMP43121 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCAMP43121 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCAMP43121 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MCAMP43121 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCAMP43121 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MCAMP43121 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCAMP43121 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCAMP43121 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCAMP43121 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCAMP43121 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCAMP43121 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCAMP43121 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MCAMP43121 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCAMP43121 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCAMP43121 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCAMP43121 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCAMP43121 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCAMP43121 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCAMP43121 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCAMP43121 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MCAMP43121 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCAMP43121 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCAMP43121 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MCAMP43121 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCAMP43121 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCAMP43121 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCAMP43121 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCAMP43121 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCAMP43121 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCAMP43121 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCAMP43121 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCAMP43121 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCAMP43121 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCAMP43121 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCAMP43121 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCAMP43121 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCAMP43121 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCAMP43121 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCAMP43121 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCAMP43121 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCAMP43121 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCAMP43121 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCAMP43121 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCAMP43121 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCAMP43121 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCAMP43121 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCAMP43121 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCAMP43121 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCAMP43121 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCAMP43121 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCAMP43121 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCAMP43121 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCAMP43121 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MCAMP43121 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MCAMP43121 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
MCAMP43121 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms