Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC1A1P43005 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC1A1P43005 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC1A1P43005 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms