Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP3P42574 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP3P42574 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP3P42574 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP3P42574 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP3P42574 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP3P42574 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP3P42574 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP3P42574 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP3P42574 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP3P42574 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP3P42574 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP3P42574 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP3P42574 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP3P42574 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP3P42574 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CASP3P42574 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP3P42574 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP3P42574 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP3P42574 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP3P42574 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP3P42574 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP3P42574 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP3P42574 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP3P42574 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP3P42574 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CASP3P42574 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP3P42574 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP3P42574 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP3P42574 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP3P42574 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP3P42574 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP3P42574 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP3P42574 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP3P42574 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CASP3P42574 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP3P42574 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP3P42574 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP3P42574 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CASP3P42574 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP3P42574 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP3P42574 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP3P42574 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP3P42574 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CASP3P42574 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP3P42574 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP3P42574 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP3P42574 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP3P42574 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP3P42574 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP3P42574 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP3P42574 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP3P42574 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP3P42574 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP3P42574 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP3P42574 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP3P42574 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP3P42574 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms