Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 NSG1YHR133C 876 nt5.32□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 MDG1YNL173C 1101 nt5.32□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 SOL1YNR034W 966 nt5.32□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 TRS33YOR115C 807 nt5.32□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 CDC4YFL009W 2340 nt5.32□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 NTH2YBR001C 2343 nt5.32□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 TPS3YMR261C 3165 nt5.32□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 MMT2YPL224C 1455 nt5.32□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 FHL1YPR104C 2811 nt5.31□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 MCX1YBR227C 1563 nt5.31□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 RPN12YFR052W 825 nt5.31□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 CAM1YPL048W 1248 nt5.31□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 YIL067CYIL067C 2037 nt5.31□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 COT1YOR316C 1320 nt5.3□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt5.3□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 DBP8YHR169W 1296 nt5.3□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 UGA2YBR006W 1494 nt5.3□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 BUD22YMR014W 1560 nt5.29□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 CYK3YDL117W 2658 nt5.29□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 JAC1YGL018C 555 nt5.29□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 MDY2YOL111C 639 nt5.29□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 TOM5YPR133W-A 153 nt5.29□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 YCL012CYCL012C 405 nt5.29□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 YEL067CYEL067C 588 nt5.28□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 VPS29YHR012W 849 nt5.28□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 SFK1YKL051W 1062 nt5.28□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 AXL2YIL140W 2472 nt5.28□□□□□ -1.56
SHQ1P40486 ARO2YGL148W 1131 nt5.27□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 SFT2YBL102W 648 nt5.27□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 NHP6AYPR052C 282 nt5.27□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 NGL2YMR285C 1548 nt5.27□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 YMR102CYMR102C 2505 nt5.27□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 NUP1YOR098C 3231 nt5.27□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 EMP46YLR080W 1335 nt5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 HXT5YHR096C 1779 nt5.26□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 ASA1YPR085C 1332 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 MNT2YGL257C 1677 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 URA3YEL021W 804 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 YGR153WYGR153W 654 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 PUS6YGR169C 1215 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 MIM2YLR099W-A 264 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 EXO1YOR033C 2109 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 EEB1YPL095C 1371 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 KRE6YPR159W 2163 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 FAP1YNL023C 2898 nt5.25□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 HOF1YMR032W 2010 nt5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 YJR124CYJR124C 1347 nt5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 YKL023WYKL023W 834 nt5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 CUE5YOR042W 1236 nt5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 MLF3YNL074C 1359 nt5.24□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 RPL12AYEL054C 498 nt5.23□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 PEX22YAL055W 543 nt5.23□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 YBR016WYBR016W 387 nt5.23□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 ECM33YBR078W 1290 nt5.23□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 YPL245WYPL245W 1365 nt5.23□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 CAF4YKR036C 1932 nt5.23□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 MPP10YJR002W 1782 nt5.22□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 IMD3YLR432W 1572 nt5.22□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 SKG3YLR187W 3081 nt5.22□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.22□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 STE20YHL007C 2820 nt5.21□□□□□ -1.57
SHQ1P40486 AIR2YDL175C 1035 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 YGL185CYGL185C 1140 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 CAB4YGR277C 918 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 ECM15YBL001C 315 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 YNL174WYNL174W 573 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 TRM10YOL093W 882 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 DRN1YGR093W 1524 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 IMA1YGR287C 1770 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 CRT10YOL063C 2874 nt5.21□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 YLH47YPR125W 1365 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 PMA1YGL008C 2757 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 PAD1YDR538W 729 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 GRX4YER174C 735 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 YJR085CYJR085C 318 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 ATG33YLR356W 594 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 CKA2YOR061W 1020 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 NPT1YOR209C 1290 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 PDR10YOR328W 4695 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 YMD8YML038C 1329 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 DBF2YGR092W 1719 nt5.2□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 FRS1YLR060W 1788 nt5.19□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 LHP1YDL051W 828 nt5.19□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.19□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 MAP2YBL091C 1266 nt5.19□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 GAS3YMR215W 1575 nt5.19□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 NOP8YOL144W 1455 nt5.19□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 UBA2YDR390C 1911 nt5.19□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 MRP21YBL090W 534 nt5.18□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 ARN2YHL047C 1863 nt5.17□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 RVB1YDR190C 1392 nt5.17□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 PRO2YOR323C 1371 nt5.17□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 PMT2YAL023C 2280 nt5.17□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 SER33YIL074C 1410 nt5.17□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 IPK1YDR315C 846 nt5.17□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 REC114YMR133W 1287 nt5.17□□□□□ -1.58
SHQ1P40486 RDL1YOR285W 420 nt5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.9 ms