Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IGHMBP2P38935 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHMBP2P38935 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms