Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RPL4P36578 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPL4P36578 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL4P36578 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL4P36578 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL4P36578 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL4P36578 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPL4P36578 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPL4P36578 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL4P36578 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL4P36578 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL4P36578 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL4P36578 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL4P36578 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL4P36578 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL4P36578 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL4P36578 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL4P36578 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL4P36578 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL4P36578 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL4P36578 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL4P36578 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL4P36578 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL4P36578 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL4P36578 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL4P36578 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL4P36578 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL4P36578 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL4P36578 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL4P36578 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms