Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5C1P36542 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5C1P36542 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5C1P36542 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5C1P36542 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP5C1P36542 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5C1P36542 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms