Protein–RNA interactions for Protein: P36068

SHE2, SWI5-dependent HO expression protein 2, yeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 246 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHE2	P36068	ARN1	YHL040C	1884 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	RPL12A	YEL054C	498 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	FHN1	YGR131W	525 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	FAF1	YIL019W	1041 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	VPS72	YDR485C	2388 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	FRS1	YLR060W	1788 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	PDR15	YDR406W	4590 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	TIM54	YJL054W	1437 nt		4.37	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	THI21	YPL258C	1656 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	CPS1	YJL172W	1731 nt		4.36	□□□□□ -1.71	RIP-Chip
SHE2	P36068	SCS2	YER120W	735 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	SLO1	YER180C-A	258 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	NPY1	YGL067W	1155 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	YGR035W-A	YGR035W-A	222 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	EGD2	YHR193C	525 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	EFM4	YIL064W	774 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	YLR118C	YLR118C	684 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	TRM10	YOL093W	882 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	GRE1	YPL223C	507 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	NHP6A	YPR052C	282 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	FAP1	YNL023C	2898 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	HOF1	YMR032W	2010 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	UGA2	YBR006W	1494 nt		4.36	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	HXT4	YHR092C	1731 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	YKL151C	YKL151C	1014 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	SNN1	YNL086W	309 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	GSP2	YOR185C	663 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	MAK3	YPR051W	531 nt		4.35	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	FAA3	YIL009W	2085 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	MMT2	YPL224C	1455 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	KAR2	YJL034W	2049 nt		4.34	□□□□□ -1.71
SHE2	P36068	CLA4	YNL298W	2529 nt		4.34	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	VID22	YLR373C	2706 nt		4.34	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	SFI1	YLL003W	2841 nt		4.34	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	NUP1	YOR098C	3231 nt		4.34	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	NUP116	YMR047C	3342 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	SEC13	YLR208W	894 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	YMR135W-A	YMR135W-A	534 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	SKG3	YLR187W	3081 nt		4.33	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	RAD16	YBR114W	2373 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	SDA1	YGR245C	2304 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	LYS2	YBR115C	4179 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	RVB1	YDR190C	1392 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	ADY2	YCR010C	852 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	GET3	YDL100C	1065 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	YLR194C	YLR194C	765 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	VHC1	YBR235W	3363 nt		4.32	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	EUG1	YDR518W	1554 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	JEM1	YJL073W	1938 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	HPC2	YBR215W	1878 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	YNL174W	YNL174W	573 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	YOR318C	YOR318C	306 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	MPP10	YJR002W	1782 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	BOP2	YLR267W	1713 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	ATH1	YPR026W	3636 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	GIP2	YER054C	1647 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	MBP1	YDL056W	2502 nt		4.31	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	NOP7	YGR103W	1818 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	SEG2	YKL105C	3399 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	MTF2	YDL044C	1323 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	AIR2	YDL175C	1035 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	PRO3	YER023W	861 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	YIM1	YMR152W	1098 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	MDG1	YNL173C	1101 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	CDC21	YOR074C	915 nt		4.3	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	YDR401W	YDR401W	564 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	RMA1	YKL132C	1293 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	TGS1	YPL157W	948 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	MRL1	YPR079W	1146 nt		4.29	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	FHL1	YPR104C	2811 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	IES1	YFL013C	2079 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	PMA1	YGL008C	2757 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	SUT1	YGL162W	900 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	PCT1	YGR202C	1275 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	JJJ3	YJR097W	519 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	CSR1	YLR380W	1227 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	SAM4	YPL273W	978 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	YPR109W	YPR109W	885 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	HXT7	YDR342C	1713 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	HXT6	YDR343C	1713 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	BRL1	YHR036W	1416 nt		4.28	□□□□□ -1.72
SHE2	P36068	ENP1	YBR247C	1452 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	HNT2	YDR305C	654 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	MF(ALPHA)2	YGL089C	363 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YGR182C	YGR182C	354 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	SYN8	YAL014C	768 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	CPR6	YLR216C	1116 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	TAF5	YBR198C	2397 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	MOT2	YER068W	1764 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	DOA1	YKL213C	2148 nt		4.27	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	YDR134C	YDR134C	411 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	RIP1	YEL024W	648 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)C	tK(CUU)C	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)D1	tK(CUU)D1	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73
SHE2	P36068	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		4.26	□□□□□ -1.73

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