Protein–RNA interactions for Protein: P35625

TIMP3, Metalloproteinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP3P35625 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TIMP3P35625 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMP3P35625 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMP3P35625 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.2 ms