Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXD12P35452 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD12P35452 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD12P35452 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms