Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	YDR034W-B	YDR034W-B	156 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YFT2	YDR319C	825 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YER148W-A	YER148W-A	579 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	GCG1	YER163C	699 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	OM45	YIL136W	1182 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YKR045C	YKR045C	552 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	ERV41	YML067C	1059 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	GLC8	YMR311C	690 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YIP3	YNL044W	531 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	ATG19	YOL082W	1248 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YOL166C	YOL166C	339 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YOR111W	YOR111W	699 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	COX11	YPL132W	903 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	TAE1	YBR261C	699 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	DPH2	YKL191W	1605 nt		5	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	MCX1	YBR227C	1563 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	KAR1	YNL188W	1302 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	SDA1	YGR245C	2304 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	MRPL7	YDR237W	879 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	COS4	YFL062W	1140 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	ARI1	YGL157W	1044 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	POP6	YGR030C	477 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	KSS1	YGR040W	1107 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	ARC19	YKL013C	516 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	ASK1	YKL052C	879 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	EMG1	YLR186W	759 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	SEC13	YLR208W	894 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YLR374C	YLR374C	390 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	TSA1	YML028W	591 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YOR008W-B	YOR008W-B	102 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	CAR1	YPL111W	1002 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	PWP1	YLR196W	1731 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	ERG8	YMR220W	1356 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	RAD7	YJR052W	1698 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	CYK3	YDL117W	2658 nt		4.99	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	CMK1	YFR014C	1341 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YTA12	YMR089C	2478 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	GIP1	YBR045C	1920 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	SDH4	YDR178W	546 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	COX3	Q0275	810 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	SFK1	YKL051W	1062 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	MHT1	YLL062C	975 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YLR317W	YLR317W	435 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YBL077W	YBL077W	432 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	HPF1	YOL155C	2904 nt		4.98	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	RNY1	YPL123C	1305 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	MEC3	YLR288C	1425 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	KAR5	YMR065W	1515 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	PRR2	YDL214C	2100 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	HSF1	YGL073W	2502 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YCR016W	YCR016W	873 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	RAD59	YDL059C	717 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	GCV1	YDR019C	1203 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YER186C	YER186C	921 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YGR204C-A	YGR204C-A	114 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YIL028W	YIL028W	399 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YIL029W-A	YIL029W-A	372 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	YIL152W	YIL152W	708 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	HOR7	YMR251W-A	180 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	GCR2	YNL199C	1605 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	SNF3	YDL194W	2655 nt		4.97	□□□□□ -1.61
SIP1	P32578	PTC1	YDL006W	846 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	UBC1	YDR177W	648 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	YFL041W-A	YFL041W-A	192 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	RPS2	YGL123W	765 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	YHR112C	YHR112C	1137 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	POR2	YIL114C	846 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	SFH5	YJL145W	885 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	SPC3	YLR066W	555 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	TFB6	YOR352W	1032 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	ECM33	YBR078W	1290 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	YBR089W	YBR089W	600 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	EFM2	YBR271W	1260 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	TUP1	YCR084C	2142 nt		4.96	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	UBP7	YIL156W	3216 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	HAP2	YGL237C	798 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	PPE1	YHR075C	1203 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	RPS0B	YLR048W	759 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	YLR169W	YLR169W	354 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	TSR2	YLR435W	618 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	SEC65	YML105C	822 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	SPG4	YMR107W	348 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	YNL019C	YNL019C	855 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	YNL033W	YNL033W	855 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	RPN7	YPR108W	1290 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	YPR114W	YPR114W	948 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	DIA3	YDL024C	1407 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	QDR3	YBR043C	2070 nt		4.95	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	ATG4	YNL223W	1485 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	GRS1	YBR121C	2004 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	MET3	YJR010W	1536 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	MRPL32	YCR003W	552 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	HEM3	YDL205C	984 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	RME1	YGR044C	903 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	PHB1	YGR132C	864 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	DBP8	YHR169W	1296 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	YIL089W	YIL089W	618 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	CBF1	YJR060W	1056 nt		4.94	□□□□□ -1.62
SIP1	P32578	YNL134C	YNL134C	1131 nt		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.4 ms