Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC8A1P32418 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC8A1P32418 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms