Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCKBRP32239 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCKBRP32239 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms